Ιατρικές πληροφορίες που αφορούν στον δότη σπέρματος φυλάσσονται με απόλυτη μυστικότητα και σε κωδικοποιημένη μορφή στην Τράπεζα Κρυοσυντήρησης Σπέρματος και στο Εθνικό Μητρώο Δοτών και Ληπτών, το οποίο πρέπει να τηρεί η Εθνική Αρχή Ιατρικώς Υποβοηθούμενης Αναπαραγωγής (ΕΑΙΥΑ). Πρόσβαση στο αρχείο αυτό επιτρέπεται μόνο στο παιδί και για λόγους σχετικούς με την υγεία του. Σε περίπτωση ανώνυμης δωρεάς, κατά ρητή νομοθετική πρόβλεψη, η ταυτότητα του προσώπου που έχει προσφέρει τους γαμέτες δεν γνωστοποιείται στα πρόσωπα που επιθυμούν να τεκνοποιήσουν ούτε στα τέκνα που προκύπτουν από τη διαδικασία. Επίσης, η ταυτότητα του παιδιού, καθώς και των γονέων του δεν γνωστοποιείται στον δότη σπέρματος.

Με απόφαση της ΕΑΙΥΑ ή άλλης αρμόδιας Αρχής είναι δυνατόν να στοιχεία του δότη να διαβιβασθούν και σε άλλο φορέα, κατά την διακίνηση του σπέρματος, προκειμένου να εξασφαλισθεί η ταυτοποίηση του δότη και να αποκλεισθούν περιπτώσεις καταστρατήγησης της νομοθεσίας, όπως για παράδειγμα: δωρεά σπέρματος μέσω περισσοτέρων της μίας τράπεζας ή επίτευξης περισσοτέρων των επιτρεπομένων γεννήσεων. Σε περίπτωση τυχόν τέτοιων αποφάσεων, ο δότης μπορεί να επικαλεστεί το δικαίωμα εναντίωσης ή του περιορισμού ή της διαγραφής των στοιχείων του, ανάλογα με το τι μπορεί να ισχύσει και να εφαρμοστεί κατά περίπτωση σύμφωνα με τον Κανονισμό Προστασίας Προσωπικών Δεδομένων ή την εκάστοτε ισχύουσα Νομοθεσία.